農業部東海區漁業生態環境監測中心掛靠于中國水產科學研究院東海水產研究所漁業生態環境實驗室。中心具漁業污染事故調查鑒定甲級資質和海洋和海岸建設項目環境影響評價乙級資質，主要開展東海區重要漁業水域常規、專項和應急監測以及常規監測公報編制、海洋和海岸建設項目的環境影響評價、溢油事故對天然漁業資源損害評估、海洋環境承載力和生態補償研究、海洋環境質量和漁業資源現狀調查與評價等工作。王云龍研究員任站長，全面負責中心事務；周進副研究員任副站長，協助開展具體工作。
本中心技術力量雄厚，設辦公室、理化指標檢測室、毒理實驗室、水文動力實驗室和海洋生物鑒定實驗室（浮游動植物、魚卵仔魚、游泳生物和底棲生物），配置了國內外一流水平的液相色譜、氣相色譜、電感耦合等離子體質譜ICP-MS、連續流動營養鹽分析儀、原子吸收分光光度計、原子熒光光譜儀、總有機碳分析儀、有機鹵素分析儀和紫外/可見分光光度計等大中型分析儀器設備。近5年來，中心承擔了百余項地方政府或企事業單位委托的海洋建設工程對環境及漁業資源影響評價任務，項目涵蓋了諸多典型的海洋或海岸工程類型，如核電站、海上風電場、火電廠、石油化工、LNG項目、大
型圍填海、碼頭、越江隧道、跨海大橋、海底管道、航道疏浚物和傾倒和尾水達標排放等；及時、公正地調查處理漁業水域污染事故10余項，為維護國家、集體和公民的合法權益提供了強有力的科學依據。相關研究成果榮獲上海市科技進步一等獎等獎項共5次。
