近日，我所擬穴青蟹項目組在擬穴青蟹轉(zhuǎn)錄組高通量454測序、組裝與注釋、信號通路分析、分子標記挖掘及與生長性狀相關(guān)的微衛(wèi)星標記篩選研究中取得一系列新進展，研究成果相繼發(fā)表在PLoS ONE、Molecular Biology Reports、Gene等國際期刊上。
擬穴青蟹屬大型海水蟹類，是我國重要的海水養(yǎng)殖和捕撈對象。項目組在國家自然科學基金項目、上海市科委基礎(chǔ)研究重點項目、中央級科研院所基本科研業(yè)務費項目等資助下，利用454二代測序技術(shù)對擬穴青蟹轉(zhuǎn)錄組進行了深度測序，現(xiàn)已獲得540 Mbp的數(shù)據(jù)量、131萬條高質(zhì)量reads、76000多條contigs及78000多個unigenes；同時，還鑒定出1.9萬多個微衛(wèi)星序列和3.6萬多個SNP位點。
項目組針對轉(zhuǎn)錄組來源的信息進行深入挖掘和應用，共開發(fā)出164個多態(tài)性微衛(wèi)星標記，驗證了91個SNP位點，獲得了線粒體全基因組序列，其中3個微衛(wèi)星標記(Scpa36、Scpa75、Spm30)與12個表型生長性狀之間具有顯著的相關(guān)性(P < 0.05)，初步確定了Scpa36位點的BC基因型、Scpa75位點的BC和BD基因型及Spm30位點的AC基因型在擬穴青蟹選擇育種中具有最大的輔助育種潛力。
該研究將促進擬穴青蟹及其相近物種的功能基因組學、種群保護遺傳學和分子輔助育種學研究的發(fā)展。
（遺傳育種與生物技術(shù)實驗室 馬洪雨）
