中國水產科學研究院東海水產研究所海南瓊海試驗基地位于海南省瓊海市長坡鎮椰林村。海南瓊海試驗基地處于熱帶季風及海洋濕潤氣候區，年均氣溫24℃，陽光年均輻射量119千卡/平方米，是“天然大溫室”，優越的海洋氣候資源為發展水產南繁提供了得天獨厚的自然條件。海南試驗基地設有綜合繁育、種苗培育、親本培育和可控環境等4個試驗車間，配備水質分析、生態生理、病害檢測及精密儀器分析實驗室，是一集水產科學研究、技術示范推廣和人才培養為一體的水產品苗種繁育試驗基地。基地周邊各種生物餌料及配合飼料配套齊全。
瓊海基地利用海南得天獨厚的自然資源優勢，重點圍繞青蟹、籃子魚、銹斑蟳、海馬等品種，綜合應用現代育種技術，篩選開發優異新種質，選育優良新品種，示范推廣新品種（系）和繁育養殖等配套技術，支撐水產種業振興行動。面向海南海水養殖產業發展，開展綠色養殖、精深加工、養殖尾水處理等技術與裝備開發，服務區域漁業高質量發展。
