我所實驗基地管理中心負責管理江蘇贛榆、浙江寧海、福建福鼎、海南瓊海等試驗基地以及依托基地共建的4個新型研發機構。近年來，實驗基地管理中心根據我所學科發展方向、科研任務規劃和各基地定位，堅持我所建設一流科研基地的目標，立足江浙滬閩，作為中試孵化平臺與產業對接窗口，以“基地+學科+團隊”模式，主持或協助創新團隊實踐、學科發展交流、科研成果中試、科研創新試驗、成果轉化、服務地方漁業、區域人才培養與學術交流、產學研示范等任務，致力于打造高標準綜合性試驗平臺、設施漁業應用示范平臺、“數智興漁”工程展示平臺、陸海繁育推一體化平臺、種質南繁保育創新平臺等不同功能定位的特色平臺，并加強規范化管理、信息化展示、智能化裝備、設施化應用等方面示范作用，深入產學研合作，為產業發展持續輸送科技動力，推進漁業現代化進程。
