• 1. 河口海岸生態(tài)系統特征及生地化循環(huán)過程

  （1） 人類活動影響下河口生境時空變化格局
  （2） 河口生源要素循環(huán)與能量流動的關鍵機理和過程
  （3） 重要漁業(yè)資源持續(xù)產出機制
  （4） 河口生態(tài)系統演替過程與生態(tài)安全

• 2. 河口海岸典型棲息地修復與重要物種養(yǎng)護

  （5） 典型棲息地生態(tài)功能評價
  （6） 受損棲息地人工修復與重建
  （7） 重要物種種群增殖放流及效果評估

• 3. 長江口水生生物種質資源發(fā)掘與利用

  （9） 優(yōu)良種質收集、鑒定與保存
  （10） 重要天然苗種資源科學合理利用
  （11） 新養(yǎng)殖對象開發(fā)及產業(yè)化
  （12） 優(yōu)良種質資源交流共享平臺

在長江口及臨近水域水生生物資源保護及生態(tài)修復方面開展了一系列創(chuàng)新性的研究工作，取得了顯著的經濟、社會和生態(tài)效益，獲得了 列重大科研成果。實驗室在國際上首次研發(fā)了基于衛(wèi)星通訊的中華鱘跟蹤標志技術，查明了中華鱘在長江口的分布洄游特征，支撐了“長江 口Ramsar國際重要濕地”劃定和“長江口中華鱘自然保護區(qū)”建立；創(chuàng)建了受傷中華鱘搶救和放流系列技術，實現了大規(guī)模的中華鱘救護 和放流；融合現代信息和管理技術，率先構建了長江口漁業(yè)資源監(jiān)測技術平臺，闡明了長江口鰻苗和蟹苗的資源變動節(jié)律，推動了農業(yè)部 “鰻苗專項特許捕撈證制度”實施，遏制了鰻苗無序過度利用；率先開展了中華絨螯蟹親蟹人工增殖放流，天然蟹苗產量顯著回升，首次科 學評估了增殖放流對天然資源的貢獻率。

天然苗種的可持續(xù)利用支撐了我國河蟹和鰻鱺每年數百億元養(yǎng)殖產業(yè)，為支撐長江口漁業(yè)資源可持續(xù)利用和豐富河口漁業(yè)科學發(fā)展提供 的現狀，以水下水生動物棲息地修復為重點，建立了“水面植物浮床+水下產卵場”相結合的三維立體式飄浮濕地，為修復水域營造一個適 于水生動物繁殖發(fā)育和索餌肥育的小生態(tài)系，起到特定受損水域生態(tài)修復的目的。近5年共承擔科研項目284項，其中已完成科研項目259項， 在研項目25項。這些項目包括國家“863”計劃、國家“948”項目、農業(yè)部行業(yè)專項、國家科技基礎條件平臺、國家重大成果轉化項目、 農業(yè)部成果轉化項目、上海市行業(yè)專項項目、上海市科委項目、上海市科技興農項目、浙江省科技計劃項目、國際合作項目、上海市地方項 目等，首次實現合同經費達6000余萬元，達到歷史最好水平。近3年，先后發(fā)表論文100余篇，申請專利20余項，授權專利40余項，獲各類 科技獎勵5項，其中包括國家科技進步二等獎1項、上海市科技進步一等獎1項、上海市科技進步二等獎1項。。